ThunderCats conta as aventuras da equipe de mesmo nome, formada pelos sobreviventes do planeta Thundera. O episódio piloto da série começa com a destruição de Thundera, forçando os ThunderCats (uma espécie de nobreza Thunderiana) a fugir de sua terra natal. A frota é atacada pelos inimigos dos Thunderianos, os mutantes de Plun-Darr, que destruiram todas as naves da frota Thunderiana, mas pouparam a nave-mãe, na esperança de capturar a lendária Espada Justiceira (Sword of Omens, no original) que eles acreditam estar a bordo. A espada tem o olho místico de Thundera, a fonte do poder dos ThunderCats, encrustado na empunhadura. Embora os Mutantes tenham causado danos à nave-mãe, o velho guardião de Lion-O, Jaga, se oferece para pilotar a nave e levá-los em segurança ao "Terceiro Mundo". No entanto, Jaga morre no processo porque a viagem leva várias décadas, mesmo com a avançada nave interestelar. Entre os personagens principais estão o jovem lorde dos ThunderCats, Lion-O, e os ThunderCats.
Êxodo
Aliança Profana
Berbils
Os Escravos do Castelo Plunn-Darr
Pumm-Ra
O Pirata Mão de Martelo
Questão de Tempo
Terra das Armadilhas
O Jardim das Delícias
Mandora, A Caçadora do Mal
O Guerreiro Fantasma
O Olhar Fatal
Senhor das Neves
A Espaçonave Enterrada
A Cápsula do Tempo
As Bolas de Fogo do Castelo Plunn-Darr
A Espada de Omens
Imagem Distorcida
Mongor
Retorno a Thundera
Doutor Dometone
Prisão Astral
A Rainha de Cristal
Safari Joe
Snarf Aceita o Desafio
O Sexto Sentido
O Thunder-Cortador
Lobo Feroz
Felliner - Parte 1
Felliner - Parte 2
Mandora e Os Piratas
O Retorno do Furão
Dimensão da Destruição
Rainha de Oito Pernas
Espada no Precipício
A Harpa do Mal de Char-Nin
Primeiro Dia do Ungido de Lion: Prova de Força
O Demolidor
Barganha de Simiano
Cilada Quase Fatal
Os Micrits
Segundo Dia do Ungido de Lion: Prova de Velocidade
O Gigante de Pedra
A Rebelião de Chacal
Turmagar, O Tuska
Terceiro Dia do Ungido de Lion: Prova de Agilidade
Mumm-Ra Berbil
Praga Mecânica
Encurralados
Quarto Dia do Ungido de Lion: Prova da Mente
Excalibur
O Segredo do Rei do Gelo
Bom e Feio
O Reator Radiativo
Dividir e Conquistar
O Mestre dos Sonhos
Fora de Alcance
A Montanha
A Poção do Super-Poder
A Própria Imagem
Quinto Dia do Ungido de Lion: Prova do Demônio
Os Gatinhos Em Apuros
Mumm-Rana
Personalidades Trocadas
Boas Lembranças
PARTE 6 - BREVE
Os Novos Thunderianos
Montanha de Fogo
Avalanche
A Volta de Hachiman
Os Novos Thundercats
Mumm-Ra Vive Parte 1
Mumm-Ra Vive Parte 2
Mumm-Ra Vive Parte 3
Mumm-Ra Vive Parte 4
Mumm-Ra Vive Parte 5
Luta de Tigres
Loucura
A Máscara de Gordon
PARTE 7 - BREVE
A Bolha Maluca
Juntos Ficamos
Ilha da Revolta
Troca do Tempo
Música Pesada
O Dia do Eclipse
O Golpe
O Cinturão de Mumm-Ra
Hachiman's Honour
Os Fujões
Na Pele do Cão
A Vingança de Abutre
A Volta Às Origens Parte 1
A Volta Às Origens Parte 2
A Volta Às Origens Parte 3
A Volta Às Origens Parte 4
A Volta Às Origens Parte 5
O Totem de Dera
A Corrente da Lealdade
Canyon de Cristal
O Raio Telepático
A Ilha do Exílio
A Chave de Thundera
Retorno Aos Thundercubos
A Fórmula
O Medalhão Que Cria Mentiras
PARTE 9 - BREVE
O Bracelete do Poder
Dando Duro
Thunderscópio
O Dragão de Jade
O Trem Circo
O Último Dia
Retorno a Thundera Parte 1
Retorno a Thundera Parte 2
Retorno a Thundera Parte 3
Retorno a Thundera Parte 4
Retorno a Thundera Parte 5
Leah
O Homem-Sapo
PARTE 10 - BREVE
A Herança
Screw Loose
Malcar
Incapaz de Rir
A Vingança de Cracker
O Monstro de Musgo
A Confusão de Ma-Mutt
O Mestre das Sombras
A Canção do Cisne
O Toque de Amortus
O Fator Zaxx
O Poço da Insegurança
O Livro da Justiça
FIM DA SÉRIE
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